熱帯医学研究所には50人(2018.7現在)の研究者が在籍し、①病原体解析部門、②宿主病態解析部門、③環境医学部門、④臨床研究部門の4つの研究部門に分かれて研究に従事しています。また、附属施設として、①アジア・アフリカ感染症研究施設、②熱帯性病原体感染動物実験施設、③熱帯医学ミュージアム、④共同研究室を設置しています。
 ※研究内容等につきましては、熱帯医学研究所HPをご覧ください。